Bali United U-21 memperkecil ketertinggalan mereka saat laga memasuki menit ke-89 melalui Ikhwan Azka.
Sebelum final ini, Persela U-21 sukses merebut posisi tiga terbaik. Anak asuh Didik Ludyanto mengalahkan Pusamania Borneo FC (PBFC) dengan skor 3-1.
Untuk top scorer ISC U-21 2016 direbut Irfan Jaya dari PSM Makassar U-21 dengan total 14 gol. Sedangkan Dimas Drajad menjadi pemain terbaik ajang ini.
Untuk peraih trofi tim Fair Play diberikan pada Persela Lamongan U-21.